La Junta és l'òrgan encarregat de gestionar Cosmos Mataró d'acord amb els estatus de l'entitat. Els càrrecs són: presidència, vicepresidència, secretaria, tresoreria i vocals. La secretaria s'encarrega de l'organització dels actes oficials, així com del manteniment del llibre d'actes, i el tresorer s'encarrega de la gestió econòmica i financera de l'agrupació.